http://webmaster.yandex.ru/ - форма для добавления сайта в базу данных Яндекса
http://www.rambler.ru/doc/add_site.shtml - аналогичная форма, но для Рамблера
http://www.google.ru/intl/ru/addurl.html - то же самое для Гугла

http://wordstat.yandex.ru/ - анализ поисковых запросов по Яндексу
https://ad.rambler.ru/swrds/wrds.pl - запросы по Рамблеру

http://www.be1.ru/stat/ - комплексный анализ продвижения сайта
http://www.promolab.ru/free/parser.php - анализ структуры сайта
http://linum.mohito.ru/ - подсчет ссылок на странице
http://www.iwebtool.com/backlink_checker - анализатор ссылок на ваш сайт (беклинков)
http://livepr.raketforskning.com/ - определение PageRank по дата-центрам
http://www.iwebtool.com/visual_pagerank/ - визуальный PR всех ссылок на странице

http://www.copyscape.com/ - сирвис для проверки на оригинальность контента сайта
http://www.antiplagiat.ru/ - АнтиПлагиат.РУ (поиск заимствованного контента)

http://web.archive.org/collections/web.html - "машина времени" показывает с какого года сущесвует домен и какой контент располагался на этом домене в определенные временные промежутки.

http://webmoney.ru/ - сайт самой распространенной в России системы электронных платежей WebMoney. На сайте вы сможете скачать программу для работы с системой и ознакомиться с инструкциями по эксплуатации.
Необходимые программы и скрипты :

http://www.site-auditor.ru/ - очень хорошая программа для комплексного анализа и мониторинга сайта. По своей функциональности заменяет массу всевозможных сервисов. На мой взгляд просто не заменимый инструмент в работе по продвижению сайта. Не требует установки и удобна в эксплуатации.

http://www.mozilla.ru/ - очень рекомендую скачать реактивный браузер Firefox, который значительно превосходит Internet Explorer (IE) по скорости работы. К тому же к Firefox существует масса дополнительных модулей "заточенных" под SEO (поисковая оптимизация).

http://www.denwer.ru/ - набор компонентов "денвер", позволяющий полностью эмулировать работу виртуального хостинга. Т.е. вы можете устанавливать, настраивать и просматривать свои сайты на персональном компьютере без выхода в сеть Internet.

http://webspec.ru/tc/ - скрипт анализатора сайта в поисковых системах на php (можно использовать как на виртуальном хостинге, так и на "денвере")
Инструменты для регистрации в каталогах:

http://www.webloganalyzer.biz/rus/allsubmitter.html - официальный сайт разработчиков программы Allsubmitter. Здесь вы можете приобрести пожалуй лучшее решение для регистрации сайтов в каталогах. Программа автоматически заполняет необходимые поля и формы, а также поддерживает режим авторегистрации (добавление в большое количество каталогов одним нажатием кнопки). Для тех кто не любит платить, есть взломанная версия программы Alsubmitter 3.3 (версия 3.4 не поддерживает авторегистрацию), которая поддерживает все необходимые функции и прекрасно работает. Я не занимаюсь распространением вареза, так что и ссылку на "паломанный" софт давать не буду. Хочу лишь заметить, что программка и "пилюля" к ней легко находятся в поисковых системах.

http://smile-group.ru/products/seotools/ - сайт разработчика программы SMILE: SEO Tools. Инструмент предназначен для тех же целей, что и предыдущая программа. Некоторые считают данный продукт более перспективным нежели Alsubmitter, но мне он показался несколько сложноватым + ресурсоемким (использует больше трафика). Опять же существует "пилюля" к этой программе, которая находится при помощи тех же поисковиков.

Белые каталоги - пройдя по этой ссылке можно скачать не плохую базу каталогов, которая периодически обновляется и проверяется мной на наличие битых ссылок, почерневших каталогов и прочего "мусора" (примерно один раз в месяц). Качественных каталогов не менее 95% от общего количества. База в txt файле, а следовательно настраивать смарт и авторегистрацию при желании вам придется самим. Предположительный прирост ТИЦ=150 пунктов, в течении одного месяца для нулевого сайта.